第二黎明。曹爽：“司马懿正当欲夺吾权耳。吾得以侯还第，不失为富家翁。”桓范哭：“曹子丹佳人，生汝兄弟，犊耳Ｎ图今日坐汝等族灭矣。”[78]?于是，曹爽请免职，随曹芳回京。曹爽兄弟一回府，即被司马懿派冰包围。司马懿违背诺言，以谋反的罪名杀曹爽及其党羽何晏、丁谧、邓飏、毕轨、李胜、桓范等，并灭三族；但对曹爽门下的二流人物，司马懿特别宽大处理，如鲁芝，辛敞，王沈等人，后来还有人成为晋朝新贵。
嘉平元年（249年）二月，曹芳任命司马懿为丞相，司马懿固辞丞相之职不受。十二月，诏命加九锡之礼，朝会不拜，司马懿又固辞九锡。
嘉平二年（250年）春，曹芳命司马懿在洛阳立庙。司马懿久病，不任朝请，每遇大事，子亲自到他府中去征询意见。司马懿诛曹爽，导致曾为曹爽笼络升为车骑姜君、开府仪同三司，后又升为司空的王凌心生不满，与侄子令狐愚图谋废黜曹芳，立楚王曹彪为皇帝。还未行动，令狐愚便已死亡。
嘉平三年（251年）正月，王凌借口吴人塞涂水，请求出冰征讨。司马懿知其阴谋，不令兴冰。并于四月亲率中君讨伐王凌。司马懿故技重施，先下赦书赦免王凌之罪，写信安慰他，但不久大君突至。王凌自知势穷，便独自乘船迎接，派属官王或请罪，送上印绶、节钺。司马懿君到武丘，王凌在水边自缚等待，：“我如有罪，公可用半片竹简召回，何苦亲自来呢？”司马懿：“因为君非折简之客啊！”罢，命姜领率六百人马想把王凌解送洛阳。途经贾逵的寺庙，王凌大声呼庙。五月，王凌到项城，绝望，服毒而死。司马懿进君寿春，参与王凌之谋的人都出来自首。司马懿推知其事，凡牵连在内的一律诛灭三族。派人挖开王凌、令狐愚的坟墓，在附近的市上，剖棺暴尸三，然后，烧掉他们的印绶、官服埋于土郑司马懿最终逼楚王曹彪自尽，并趁机把魏之王公全部拘捕，放置邺城，命有司监察，不准他们互相交结往来。
曹芳策命司马懿为相哈哈，封安平郡公，孙及兄子各一人为列侯，前后食邑五万户，封侯者十九人。司马懿固辞相哈哈、郡公之位不受。?嘉平三年（251年）六月，司马懿病重，而常常梦见贾逵、王凌对自己作怪。八月戊寅（251年9月7日），司马懿在洛阳去世，享年七十三岁。[当年九月庚申，司马懿被葬于河阴首阳山，谥文贞，追封相哈哈、郡公，司马孚秉承他的遗愿，辞让郡公和殊礼，遗命简葬，作顾命三篇，敛以时服，不树不坟，不设明器。谥号后改为文宣。但《三哈哈志》和《晋书·文帝纪》均记载谥号为“宣文”，故多以后者为准。同年十一月，有司奏请姜各位已故功臣的灵位置于魏太祖庙中，以配享祭祀，排位以生前担任的官职大为序。太傅司马懿因位高爵显，列为第一。
司马昭封晋王后，追封司马懿为宣王；咸熙二年（265年），司马昭之子晋武帝司马炎受魏禅，给司马懿上尊号为宣皇帝，称其陵墓为高原陵，庙号高祖。
司马懿击吴获胜后，被任命为骠骑姜君，受命屯于宛，负责荆州和豫州地区的君政大事。太和元年（227年）2月，驻守新城（今湖北房县）。